[LAB]Windows 10にSimpleElastixをインストールする

開発環境

※anaconda仮想環境で行う
★アスタリスク付きアイテムは特に重要な部分

SimpleElastixのインストール

1.Visual Studioのインストール

どのバージョンでも構わない.

★1-1. VS InstallerでC++を使ってデスクトップ開発インストール★

CMakeツールを使用してインストールする必要があります.

2.CMakeのインストール

Windows x 64 ZIPファイルをダウンロードします.

2-1. CMakeとは?

CMakeはソフトウェアプロジェクトのオープンソース構築マネージャです.
開発者が作成したCMakeList.txtは、ユーザが独自の開発環境に基づいて構築することができる.

2-2. CMakeの実行

ダウンロードしたファイルを解凍します.
cmake-3.21.2-windows-x 86 64>bin>cmake-guiの順に入るとcmakeを実行できます.

3.SimpleElastixソースコードのインポート

anaconda仮想環境の端末からSimpleElastixソースコードを取得します.

git clone https://github.com/kaspermarstal/SimpleElastix

4.構築フォルダの作成

SimpleElastixフォルダが存在する場所に構築フォルダを作成します.

★5. CMakeで構築★

次の図のように、ConfigureとGenerateをクリックしてdoneが正常に構築されました.

source code
SimpleElastixフォルダのSuperBuildフォルダを指定します.

binaries
上に作成したコンストラクションフォルダを指定します.

※経路長が50を超えない限りエラーは発生しません.

5-1. CMakeの設定

Specify the generator for this project
現在のインストールに適したVisual Studioバージョンを選択します.

★5-2. パッケージフォルダで設定します。pyファイルをコピー★

build > SimpleITK-build > Wrapping > Python > Packaging
フォルダに順番に入ると、次のフォルダとファイルが表示されます.
ここでsetuppyファイルをコピーします.

★5-3. Pythonフォルダで設定します。pyファイルを貼り付け★

上に入力したパスの前のフォルダにPythonフォルダを設定します.pyファイルを貼り付けます.

6.Visual Studioで構築

プロジェクトまたはソリューションを開く
ビルドフォルダのSuperBuildSimpleITK.slnを開きます.

ソリューションブラウザ上部のALL BUILDを右クリックし、「構築」をクリックして構築を開始します.

約2時間が過ぎて、ビルが成功すれば成功した.

7. setup.pyのインストール

buildフォルダで、下図のようにsetupに入ります.pyファイルが存在します.

7-1. 端末からのインストール

> build\SimpleITK-build\Wrapping\Python>python setup.py install

7-2. jupyter notebookにインストールする

setup.pyファイルが存在する場所でjupyter notebookを実行するのは便利です.

python setup.py install

8.簡単なElastixインストールの検証

SimpleITKをインストールした場合、Elastix関連関数が表示されると成功します.