123_01.csv
123_02.csv
123_03.csv
124_01.csv
124_02.csv
125_01.csv

import pandas as pd
import glob
import copy

# パスで指定したファイルの一覧を名前順にリスト形式で取得
csv_files = sorted(glob.glob('test/*.csv'))

for i in csv_files:#対象のファイルを一覧で表示
    print(i)

csv_files_copy = copy.deepcopy(csv_files)#csv_files_copyにcsv_filesをコピー

while len(csv_files_copy):#csv_files_copyが空になるまでループ
    data_list = []#csvファイルの中身を追加していくリストを用意
    data_list.append(pd.read_csv(csv_files_copy[0]))
    parent_file = []
    parent_file = csv_files_copy.pop(0)#csv_files_copyの先頭を削除しつつ親ファイルリストに格納 

    for file in csv_files_copy:
        child_file = []
        child_file = file#親ファイルと比較するファイルの名前を子ファイルリストに格納
        if parent_file[-6:] == child_file[-6:]:#二つのファイルの"下二桁.csv"が同じ
            data_list.append(pd.read_csv(file))#data_listに追加
            csv_files_copy.remove(file)#csv_files_copyから削除

    #リストを全て行方向に結合
    #axis=0:行方向に結合, sort
    df = pd.concat(data_list, axis=0, sort=True)
    output = "test/total" + parent_file[-6:]
    df.to_csv(output,index=False)#fファイル名"taotal下二桁.csv"で出力する