2. クラスター計算機で udocker を利用する: インストール編
udockerをインストールする
紹介編に引き続いてインストールの手順を書いてみる
githubにあるudockerのインストールマニュアルに従ってインストール
以上終わり
これだけではちょっとあれなので、マニュアルに従って説明
インストールの前に
次の事を確認してほしい
- pythonが動作する
- curlコマンドが動作する
具体的には次の様なコマンドを実行してエラーがでなければOK
$ に続いている文字列が入力したコマンド
$ python --version
Python 2.7.5
$ curl --version
curl 7.29.0 (x86_64-redhat-linux-gnu) libcurl/7.29.0 NSS/3.16.2.3 Basic ECC zlib/1.2.7 libidn/1.28 libssh2/1.4.3
Protocols: dict file ftp ftps gopher http https imap imaps ldap ldaps pop3 pop3s rtsp scp sftp smtp smtps telnet tftp
Features: AsynchDNS GSS-Negotiate IDN IPv6 Largefile NTLM NTLM_WB SSL libz
念の為に書いておくけれど、実際には次の2つコマンドを実行してその結果と共に表示したもの
python --version
curl --version
動作しない時は、システム周りに詳しい知人又はシステムの管理者に相談するのがお勧め
インストール
$ curl https://raw.githubusercontent.com/indigo-dc/udocker/master/udocker.py > udocker
% Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current
Dload Upload Total Spent Left Speed
100 258k 100 258k 0 0 607k 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 606k
$ chmod u+rx ./udocker
$ ./udocker install
Info: installing 1.1.1
Info: installing from: https://cernbox.cern.ch/index.php/s/VC7GuVWA7mYRAiy/download
Error: in download: HTTP/1.1 500 Internal Server Error
Info: installing from: https://owncloud.indigo-datacloud.eu/index.php/s/AFImjw8ii0X72xf/download
./udocker install でErrorが出ている部分https://cernbox.cern.ch/index.php/s/VC7GuVWA7mYRAiy/downloadからのダウンロードは失敗しているけれども、次のhttps://owncloud.indigo-datacloud.eu/index.php/s/AFImjw8ii0X72xf/downloadからは正常にダウンロードできているという事なので、インストール手順はちゃんと実行できている
（環境によっては違った結果になる）
正常にインストールできたかhelpコマンドで確認
$ ./udocker help
Syntax:
udocker <command> [command_options] <command_args>
Commands:
search <repo/image:tag> :Search dockerhub for container images
pull <repo/image:tag> :Pull container image from dockerhub
images :List container images
create <repo/image:tag> :Create container from a pulled image
ps :List created containers
rm <container> :Delete container
run <container> :Execute container
inspect <container> :Low level information on container
name <container_id> <name> :Give name to container
rmname <name> :Delete name from container
rmi <repo/image:tag> :Delete image
rm <container-id> :Delete container
import <tar> <repo/image:tag> :Import tar file (exported by docker)
import - <repo/image:tag> :Import from stdin (exported by docker)
load -i <exported-image> :Load image from file (saved by docker)
load :Load image from stdin (saved by docker)
export -o <tar> <container> :Export container rootfs to file
export - <container> :Export container rootfs to stdin
inspect <repo/image:tag> :Return low level information on image
verify <repo/image:tag> :Verify a pulled image
clone <container> :duplicate container
protect <repo/image:tag> :Protect repository
unprotect <repo/image:tag> :Unprotect repository
protect <container> :Protect container
unprotect <container> :Unprotect container
mkrepo <topdir> :Create repository in another location
setup :Change container execution settings
login :Login into docker repository
logout :Logout from docker repository
help :This help
run --help :Command specific help
Options common to all commands must appear before the command:
-D :Debug
--quiet :Less verbosity
--repo=<directory> :Use repository at directory
Examples:
udocker search fedora
udocker pull fedora
udocker create --name=fed fedora
udocker run fed cat /etc/redhat-release
udocker run --hostauth --hostenv --bindhome fed
udocker run --user=root fed yum install firefox
udocker run --hostauth --hostenv --bindhome fed firefox
udocker run --hostauth --hostenv --bindhome fed /bin/bash -i
udocker run --user=root fed yum install cheese
udocker run --hostauth --hostenv --bindhome --dri fed cheese
udocker --repo=/home/x/.udocker images
udocker -D run --user=1001:5001 fedora
udocker export -o fedora.tar fedora
udocker import fedora.tar myfedoraimage
udocker create --name=myfedoracontainer myfedoraimage
udocker export -o fedora_all.tar --clone fedora
udocker import --clone fedora_all.tar
Notes:
* by default the following host directories are mounted in the
container:
/dev /proc /sys
/etc/resolv.conf /etc/host.conf /etc/hostname
* to prevent the mount of the above directories use:
run --nosysdirs <container>
* additional host directories to be mounted are specified with:
run --volume=/data:/mnt --volume=/etc/hosts <container>
run --nosysdirs --volume=/dev --volume=/proc <container>
See: https://github.com/indigo-dc/udocker/blob/master/SUMMARY.md
インストールを確認した
今日はここまで
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この問題について(2. クラスター計算機で udocker を利用する: インストール編), 我々は、より多くの情報をここで見つけました https://qiita.com/percipere/items/f9b7a7ac9291c0cc4566著者帰属：元の著者の情報は、元のURLに含まれています。著作権は原作者に属する。
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