【Bioinfo Blog 014】【Shell】——さまざまなコマンドレコードがめちゃくちゃ

目次

1.圧縮/解凍

1.1 .tar

1.2 .zip

1.3 .gz

.プロセス管理

2.1ロットkill

2.2バックグラウンドプロセスの表示

3.テキスト操作

3.1一括削除ファイル名数文字

1.圧縮/解凍
1.1 .tar
-z:gzipを使用してファイルを圧縮および解凍します-v:--verbose詳細リスト処理のファイル-f:--file=ARCHIVEファイルまたはデバイスを使用します.このオプションは通常必須です.-c:--createは新しいアーカイブ(圧縮パッケージ)を作成します.-x:圧縮パッケージからファイルを解凍します.

ファイルfile 1とディレクトリdir 2をtest.tar.gz

に圧縮

tar -zcvf test.tar.gz file1 dir2

解凍test.tar.gz(cをxに変えればよい)

tar -zxvf test.tar.gz

圧縮ファイルの内容

をリストする.

tar -ztvf test.tar.gz 

1.2 .zip

圧縮ファイル

zip -r test.zip file

解凍ファイル

unzip all.zip

1.3 .gz

圧縮ファイル

gzip file

解凍ファイル

gunzip file.gz

2.プロセス管理
2.1ロットkill
dumpは走るコマンドであり、stu 18230130はクラスタ内のユーザの名前である.

ps -ef | grep dump | grep stu18230130 | awk '{print $2}' | while read id; do kill $id; done

2.2バックグラウンドプロセスの表示

ps -a -o pid,pcpu,pmem,vsz,rss,tty,stat,start,time,comm,args,user

3.テキスト操作
3.1ファイル名の数文字を一括削除
.idat.gzで終わるファイルをリストします.{11}は削除前の11文字を表します.

for file in `ls *.idat.gz`;do mv $file `echo $file|sed 's/.\{11\}//'`;done;