ウイルス感染検出プログラム(BFモードマッチング)18計科学用

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using namespace std;

typedef struct{   
   char ch[600];				//     ，         ，  ch NULL   
   int len;				//      
}HString; 


int Index_BF(HString S,HString T,int pos)
{//    T   S  pos             。    ，     0 
 //  ，T  ，1≤pos≤StrLength(S) 
	int i,j;
   i=pos; j=1;   
   while(i<=S.len&&j<=T.len)
   { 
      if(S.ch[i]==T.ch[j]){++i;++j;}	//         
      else{i=i-j+2;j=1;}	//          
   }   
   if(j>T.len) return i-T.len;   
   else return 0;   
} 

void Virus_detection()
{ 
   int num,m,flag,i,j; char Vir[600];
   HString Virus,Person,temp;
   ifstream inFile("          .txt");
   ofstream outFile("          .txt");
   inFile>>num;//         
   while(num--) //        DNA   DNA    
   {
      inFile>>Virus.ch+1;//    DNA  
      inFile>>Person.ch+1;//    DNA  
      strcpy(Vir,Virus.ch);
	  Virus.len=strlen(Virus.ch)-1;
	  Person.len=strlen(Person.ch)-1;
	  flag=0;//        ，   0，     0
	  m=Virus.len;
      for(i=m+1,j=1;j<=m;j++) Virus.ch[i++]=Virus.ch[j];
      //      ，         2 
      //           Virus.len    
      Virus.ch[2*m+1]='\0';				//      
      for(i=0;i