Linuxプラットフォームの下でJNIを使います。

参考:http://www.ibm.com/developerworks/cn/java/l-linux-jni/
ただし、参考中のバージョンは古すぎて、初心者の参照には不利です。
環境：gentoo、jdk-1.6、gcc version 4.3.4（Gentoo 4.3.4 p 1.0、pie-105.1.5）
1.
$vi Hello Jni.java

$ cat HelloJni.java 
class HelloJni {

    public native void SayHello(String name);

    static {
        try {
            System.loadLibrary("HelloJni");
        }
        catch (UnsatisfiedLinkError e) {
            System.err.println("Cannot load HelloJni library:
 " +
                    e.toString());
        }
    }

}

2.

 $ export CLASSPATH=.:$CLASSPATH
 $ javac HelloJni.java

3.

$ javah -classpath . HelloJni

4.
$vim Hello Jni.cpp

$ cat HelloJni.cpp 
#include "HelloJni.h"
#include <stdio.h>

//@see HelloJni.h function
JNIEXPORT void JNICALL Java_HelloJni_SayHello (
        JNIEnv * env, jobject arg, jstring instring) {
    // instring          UTF     
    const jbyte *str = 
        (const jbyte *)env->GetStringUTFChars(instring, JNI_FALSE);
    printf("Hello, %s
", str);
    //               str  Java   。
    env->ReleaseStringUTFChars(instring, (const char *)str);
    return;
}

5.

$ g++ -fPIC -O2 -shared -Wl,-soname,libHelloJni.so.1 -o libHelloJni.so.1.0 -I/opt/sun-jdk-1.6.0.17/include/ -I/opt/sun-jdk-1.6.0.17/include/linux HelloJni.cpp

$ ln -sf libHelloJni.so.1.0 libHelloJni.so.1
$ ln -sf libHelloJni.so.1 libHelloJni.so

lrwxrwxrwx 1 mg mg   16 2010-04-07 13:28 libHelloJni.so -> libHelloJni.so.1
lrwxrwxrwx 1 mg mg   18 2010-04-07 13:28 libHelloJni.so.1 -> libHelloJni.so.1.0
-rwxr-xr-x 1 mg mg 6659 2010-04-07 14:20 libHelloJni.so.1.0

6.
$vim ToSay.java

$ cat ToSay.java 
import java.util.*;

public class ToSay {
    public static void main(String argv[]) {
        ToSay say = new ToSay();
    }
    
    public ToSay() {
        HelloJni h = new HelloJni();
        //       Marlgl  
        h.SayHello("Marlgl");         
    }
}

 $ javac ToSay.java
 $ java ToSay
 Hello, Marlgl