Anacondaのインストールに失敗しMinicondaを入れた話
対象読者
Amazon Linux 2へのAnacondaに失敗し、後述のエラー[7149] Failed to execute script entry_point
が得られて困っている人。
結論
エラーの原因はディスク容量が足りないことかもしません。
MinicondaおよびJupyterlabをインストールするには1GB以上の空き容量を確保しましょう。
環境
- Amazon Linux 2
エラー本文
Anaconda3 will now be installed into this location:
/home/ec2-user/anaconda3
- Press ENTER to confirm the location
- Press CTRL-C to abort the installation
- Or specify a different location below
[/home/ec2-user/anaconda3] >>>
PREFIX=/home/ec2-user/anaconda3
Unpacking payload ...
concurrent.futures.process._RemoteTraceback:
'''
Traceback (most recent call last):
File "concurrent/futures/process.py", line 368, in _queue_management_worker
File "multiprocessing/connection.py", line 251, in recv
TypeError: __init__() missing 1 required positional argument: 'msg'
'''
The above exception was the direct cause of the following exception:
Traceback (most recent call last):
File "entry_point.py", line 69, in <module>
File "concurrent/futures/process.py", line 484, in _chain_from_iterable_of_lists
File "concurrent/futures/_base.py", line 611, in result_iterator
File "concurrent/futures/_base.py", line 439, in result
File "concurrent/futures/_base.py", line 388, in __get_result
concurrent.futures.process.BrokenProcessPool: A process in the process pool was terminated abruptly while the future was running or pending.
[7149] Failed to execute script entry_point
インストールの流れ
インストーラのダウンロード
Anaconda3 will now be installed into this location:
/home/ec2-user/anaconda3
- Press ENTER to confirm the location
- Press CTRL-C to abort the installation
- Or specify a different location below
[/home/ec2-user/anaconda3] >>>
PREFIX=/home/ec2-user/anaconda3
Unpacking payload ...
concurrent.futures.process._RemoteTraceback:
'''
Traceback (most recent call last):
File "concurrent/futures/process.py", line 368, in _queue_management_worker
File "multiprocessing/connection.py", line 251, in recv
TypeError: __init__() missing 1 required positional argument: 'msg'
'''
The above exception was the direct cause of the following exception:
Traceback (most recent call last):
File "entry_point.py", line 69, in <module>
File "concurrent/futures/process.py", line 484, in _chain_from_iterable_of_lists
File "concurrent/futures/_base.py", line 611, in result_iterator
File "concurrent/futures/_base.py", line 439, in result
File "concurrent/futures/_base.py", line 388, in __get_result
concurrent.futures.process.BrokenProcessPool: A process in the process pool was terminated abruptly while the future was running or pending.
[7149] Failed to execute script entry_point
インストーラのダウンロード
公式サイトより、CPUのインストラクションセットに合わせてx86_64のインストーラをダウンロードします。
インストラクションセットは以下のコマンドで確認します。
$ uname -a
Linux ip-10-0-0-33.ap-northeast-1.compute.internal 4.14.203-156.332.amzn2.x86_64 #1 SMP Fri Oct 30 19:19:33 UTC 2020 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
インストーラ実行
以下のコマンド実行によって、記事冒頭に示したエラーが出力されました。
$ sudo chmod +x ./Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh
$ ./Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh
もう一度、念のため上書きオプションをつけてインストーラを再度実行してみました。
$ ./Anaconda3-2020.11-Linux-x86_64.sh -u
初回インストール時とは異なるエラーが出てきました。
どうやらディスクにスペースがなかったらしいです。
[/home/ec2-user/anaconda3] >>>
PREFIX=/home/ec2-user/anaconda3
Unpacking payload ...
Failed to write all bytes for certifi/cacert.pem
fwrite: No space left on device
Crypto/Cipher/_raw_blowfish.cpython-38-x86_64-linux-gnu.so could not be extracted!
fopen: No space left on device
原因であったディスクスペース不足の調査
df -h
コマンドで確認してみると、このサーバにはそもそも8GBしかディスク容量が用意されていませんでした。。
その8GBを100%使い切ってしまっている状況でした。
$ df -h
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/xvda1 8.0G 8.0G 20K 100% /
sudo du -sh ./* | less
にてルートディレクトリのどこで容量を埋め尽くしているか確認しました。
掘り下げていくと、Anaconda自体のサイズが2.3GBであったため、8GBしかディスクサイズがないこの環境で利用するのは無謀と判断しました。
Anacondaを一度削除して、Minicondaを入れなおしてみるとインストールに成功しました。
※容量が小さいのでインストーラは即削除しました。
sudo rm -rf ~/anaconda3
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sudo chmod +x ./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sudo ./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sudo rm ./Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
無事、Minicondaのインストールが完了しました。
さあ、残り2.5GBでJupyterlabまで使えるようになるのか...!?
$ df -h
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/xvda1 8.0G 5.6G 2.5G 70% /
conda install -c conda-forge jupyterlab
にてじjupyterlabをインストール。
MJupyterlabのインストールのディスク容量消費は0.6GB程度だったので、何とかなりました。
$ df -h
Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on
/dev/xvda1 8.0G 6.2G 1.9G 78% /
最終的にMinicondaとJupyterlabを合わせて1GB程度のディスク消費で収まり、無事目的は達成されました。
Author And Source
この問題について(Anacondaのインストールに失敗しMinicondaを入れた話), 我々は、より多くの情報をここで見つけました https://qiita.com/kazukiigeta/items/3c193d590acd723ba7b7著者帰属:元の著者の情報は、元のURLに含まれています。著作権は原作者に属する。
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