pip環境のdockerでjupyter notebookを使いたかった（opticspy）

4244 ワード
Python3 Python pip Jupyter Docker Python テキストリンク

背景

  • Dockerで環境構築してpythonコードを書く際，画像の結果を見るのにjupyter notebookが楽
  • opticspyというモジュールを使ったシミュレーションをしようとした時，pip installが前提となっていた
  • Jupyterは普段anaconda環境下で使っているので，どうしたら良いか調べながら対処した

Dockerfile

FROM continuumio/anaconda3:latest


RUN apt-get update && apt-get upgrade -y \
 && apt-get install -y \
    git \
    make \
    build-essential \
    libssl-dev \
    zlib1g-dev \
    libbz2-dev \
    libreadline-dev \
    libsqlite3-dev \
    wget \
    curl \
    llvm \
    libncurses5-dev \
    libncursesw5-dev \
    xz-utils \
    tk-dev \
    libffi-dev \
    liblzma-dev \
    vim

RUN conda create -n p37 python=3.7 pip

実行コード

terminal.sh
$ docker run -it -p 8881:8881 -v /hogehoge/:/mnt/ --name pip_in_conda pip_in_conda:1.0
$ source activate p37
$ pip install jupyter
$ pip install environment_kernels
$ jupyter notebook --generate-config
$ vim /root/.jupyter/jupyter_notebook_config.py

vimで追記する内容は以下の通り

jupyter_notebook_config.py
c.NotebookApp.kernel_spec_manager_class='environment_kernels.EnvironmentKernelSpecManager'
c.EnvironmentKernelSpecManager.env_dirs=['/opt/conda/envs/']
terminal.sh
$ pip install cffi
$ pip install numpy
$ pip install git+git://github.com/Sterncat/opticspy.git@master
$ pip install pyyaml
$ jupyter notebook --port 8881 --ip=0.0.0.0 --allow-root

opticspyのサンプルコード実行の様子