DNA-白俊(1969,完全探索)

🎯 DNA

🧐 アルゴリズム[メソッド]

👨‍💻 ソース

import java.util.*;

public class Main {
  
  public static final String[] DNAType = {"A", "T", "G", "C"};  // DNA 종류 선언
  
  public static void main(String[] args){
    
    Scanner sc = new Scanner(System.in);
    
    int N = sc.nextInt(); // DNA 수
    int M = sc.nextInt(); // 문자열 길이
    sc.nextLine();
    
    char[][] arr = new char[N][M];
    for(int i = 0 ; i < N ; i++) {
     String  s = sc.nextLine();
     arr[i] = s.toCharArray();
    }

    ArrayList<String> DNAList = new ArrayList<String>();
    for(int i = 0 ; i < M ; i++) {
      
      // DNA[0] : Adenine, DNA[1] : Thymine, DNA[2] : Guanine, DNA[3] : Cytosine
      int[] DNA = new int[4];
      for(int j = 0 ; j < N ; j++) {
        char c = arr[j][i];
        
        if(c == 'A') {
          DNA[0]++;
        } else if(c == 'T') {
          DNA[1]++;
        } else if(c == 'G') {
          DNA[2]++;
        } else {
          DNA[3]++;
        }
      }
      
      int maxCount = 0;
      String maxDNA = "";
      for(int j = 0 ; j < 4 ; j++) {
        if(maxCount < DNA[j]) {
          maxCount = DNA[j];
          maxDNA = DNAType[j];
        } else if(maxCount == DNA[j]) {
          maxDNA += DNAType[j];
        }
      }
      
      DNAList.add(maxDNA);
    }
    
    // Hamming DNA 구하기
    String HammingDNA = "";
    for(int i = 0 ; i < DNAList.size() ; i++) {
      char[] c = DNAList.get(i).toCharArray();
      Arrays.sort(c);
      HammingDNA += String.valueOf(c[0]);
    }
    
    
    // Hamming Distance 구하기
    int HammingDistance = 0;
    for(int i = 0 ; i < M ; i++) {
      for(int j = 0 ; j < N ; j++) {
        if(arr[j][i] != HammingDNA.charAt(i)) {
          HammingDistance++;
        }
      }
    }
    
    System.out.println(HammingDNA);
    System.out.println(HammingDistance);
    
    sc.close();
    
  }
  
}

🏅 結果

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