遺伝研スパコンでRを使えるようにする


完全に自分の備忘録用です。
すみません。

ssh ユーザー名@gw.ddbj.nig.ac.jp

[xxx@atxxx ~]$qlogin
[xxx@atxxx ~]$ R --version
bash: R: コマンドが見つかりませんでした...

Rが使えない。

スパコンのページを見ると「環境(モジュールファイル)をロードすることで、環境設定をユーザ環境に反映し利用可能にします。 」って書いてある。

[xxx@atxxx ~]$ module load r/3.5.2

[xxx@atxxx ~]$ R --version
R version 3.5.2 (2018-12-20) -- "Eggshell Igloo"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under the terms of the
GNU General Public License versions 2 or 3.
For more information about these matters see
http://www.gnu.org/licenses/.

使えるようになりました。