※ 勉強中につき間違いがあるかもしれません

停止

• データ：インスタンスストア内データは削除されます。
• 料金の扱い：停止した時点で課金時間stop。次に起動した時点で新しく1h開始。

再起動

• データ：インスタンスストア内データも含め保持される。
• 料金の扱い：新しく課金時間が開始されるわけではなく、そのまま課金時間が継続される。

課金時間例

12:00に起動開始。

• 12:20に停止、12:30に起動した場合。
  12:00 - 12:20で1h分の課金時間。
  12:30 - 13:30で1h分の課金時間。

• 12:20に再起動した場合。
  12:00 - 13:00で1h分の課金時間。

結論

停止→起動はやめて再起動の方がよさ気。