Hierarchical Cluster階層クラスタリング

2206 ワード

R:Hierarchical Cluster階層クラスタリング
2年前(2014-10-05 12:05)に発表された読書(
1884)|コメント(
0) 
0人はこの文章を収集して、私は収集します
いいね
0
ディレクトリ[-]
構築データ:クラスタリング:2つのクラスタに分割:参照:構築データ:
?
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14 > dataset = matrix(c(1,2, + 1.2,2, + 8,9, + 0.9,1.8, + 7,10, + 8.8,9.2), nrow=6, byrow=T) > dataset       [,1] [,2] [1,]  1.0  2.0 [2,]  1.2  2.0 [3,]  8.0  9.0 [4,]  0.9  1.8 [5,]  7.0 10.0 [6,]  8.8  9.2
クラスタリング:
?
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19 > d = dist(dataset) > d             1          2          3          4          5 2  0.2000000                                            3  9.8994949  9.7590983                                 4  0.2236068  0.3605551 10.1118742                      5 10.0000000  9.8812955  1.4142136 10.2200783           6 10.6150836 10.4690019  0.8246211 10.8245092  1.9697716 > hclust(d, method = "complete" )
  Call: hclust(d = d, method = "complete" )
  Cluster method   : complete Distance         : euclidean Number of objects: 6
  > hc = hclust(d, method = "complete" ) > plot(hc)
2つのクラスタに分割:
?
1
2
3 > democut<-cutree(hc,k=2) > democut [1] 1 1 2 1 2 2
参照先:
http://www.r-tutor.com/gpu-computing/clustering/hierarchical-cluster-analysis http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/stats/html/hclust.html http://ecology.msu.montana.edu/labdsv/R/labs/lab13/lab13.html