• Amazon EC2 Linux インスタンスに SSM エージェント を手動でインストールする
• 起動時に Amazon EC2 Linux インスタンスへ SSM エージェントをインストールする方法

上記の内容の 要点のみ です。
Amazon Linux 2 で SSMエージェントはデフォルトでインストールされる様ですが、
起動時から最新版を使用したいケースのメモです。

TL;DR

EC2起動時に「ユーザーデータ」にスクリプトを設定します。

環境

OS：Amazon Linux 2です。

SSM エージェント を Amazon Linux 2 にインストールするには..

次のコマンドを実行します。

sudo yum install -y https://s3.amazonaws.com/ec2-downloads-windows/SSMAgent/latest/linux_amd64/amazon-ssm-agent.rpm

SSM エージェント が実行中であるかどうかを調べるには..

次のコマンドを実行します。

sudo systemctl status amazon-ssm-agent

「ユーザーデータ」に設定するスクリプトは..

#!/bin/bash
cd /tmp
sudo yum install -y https://s3.amazonaws.com/ec2-downloads-windows/SSMAgent/latest/linux_amd64/amazon-ssm-agent.rpm
sudo systemctl start amazon-ssm-agent

実際に比べてみた

AMI： amzn2-ami-hvm-2.0.20190618-x86_64-gp2 (ami-0c3fd0f5d33134a76)
でユーザーデータの設定無しと有りで比較した結果です。

重要

新しい機能が Systems Manager に追加されるか、既存の機能が更新されると必ず、更新されたバージョンの SSM エージェント がリリースされます。古いバージョンのエージェントがインスタンスで実行されていると、SSM エージェント プロセスによっては失敗することがあります。そのため、インスタンス上で SSM エージェント を最新に維持するプロセスを自動化することをお勧めします。詳細については、SSM エージェント への更新の自動化 を参照してください。SSM エージェント の更新に関する通知を受け取るには、SSM エージェント のリリースノートのページをサブスクライブします。