mol2psをMacOS Catalinaで使えるようにする
mol2ps実行時の「bad CPU type in executable」への対応
背景
mol形式のファイルを、pngに変換する時に、mol2psを使用していた。
以前は、下記のページからダウンロードして、実行件をchmodで付与すれば使用できた。
https://homepage.univie.ac.at/norbert.haider/cheminf/mol2ps.html
(ここで「Mac OS X (x86) executable: mol2ps-latest-macosx-x86.gz 」をダウンロード)
MacOSをCatalinaに変更した後、同様の手順を行うと下記のエラーが表示された。
~ $ mol2ps
zsh: bad CPU type in executable: mol2ps
「Apple dropped support for 32bit executables with Catalina 10.15.」が原因?
「Mac OS X (x86) executable」をダウンロードしたのだから、こう言われれるのですね......
もう32ビットにはサポートしてくれないんだ ぐすん...
対応策
ソースから
1. Free Pascalをインストールする
~ $ brew install fpc
==> Pouring fpc-3.0.4_1.catalina.bottle.tar.gz
/usr/local/Cellar/fpc/3.0.4_1: 3,309 files, 190.1MB
2. ソースをダウンロードして、コンパイルする
mol2psのページにはソースコードもあるのでまずこれをダウンロード source code: mol2ps.pas
コンパイルは1.で用意したFree pascalを使用する
$ fpc mol2ps.pas -S2
Free Pascal Compiler version 3.0.4 [2019/10/11] for x86_64
Copyright (c) 1993-2017 by Florian Klaempfl and others
Target OS: Darwin for x86_64
Compiling mol2ps.pas
Assembling (pipe) mol2ps.s
Linking mol2ps
ld: warning: building for macOS 10.5 is deprecated
8870 lines compiled, 13.1 sec
$ ls -lth |head -n2
total 36240
-rwxr-xr-x 1 hoge staff 1.4M 5 18 15:41 mol2ps
pascalは初心者以下のレベル、初めて使った.....
fpc -hコマンドでオプションを調べて、「-S2 Same as -Mobjfpc」だけ付けてみた。
※ 詳しい方がいらしたら教えてください(モヤモヤしています、追記したいです)
3. コンパイルされたmol2psを使ってmol→psの変換を実行
$ ./mol2ps --bgcolor=white --scaling=1.0 sample.mol > sample.ps
Author And Source
この問題について(mol2psをMacOS Catalinaで使えるようにする), 我々は、より多くの情報をここで見つけました https://qiita.com/taro373/items/78cac94628b66cebc62a著者帰属:元の著者の情報は、元のURLに含まれています。著作権は原作者に属する。
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