Rの2系をbrew installする
Rのパッケージは、今のところ2系にしか対応していないものも多いため、3系だけだと困ることがある。
Rをbrew installすると3系がインストールされる。
$ brew update
$ brew install gfortran
$ brew tap homebrew/science
$ brew info R
R: stable 3.1.0, HEAD
http://www.r-project.org/
Not installed
From: https://github.com/homebrew/homebrew-science/commits/master/r.rb
(省略)
バージョンを変更してインストールするにはbrew versionsを使う。
インストール可能なバージョンを確認したら、対象のものをcheckoutする。
$ brew versions R
3.1.0 git checkout b81a08f r.rb
(省略)
2.15.3 git checkout 064c0db r.rb
(省略)
$ cd /usr/local/Library/Taps/homebrew/homebrew-science
$ git checkout 064c0db r.rb
$ brew info R
R: stable 2.15.3, HEAD
http://www.r-project.org
Not installed
From: https://github.com/homebrew/homebrew-science/commits/master/r.rb
これで2系のRをインストールできると思いきや、makeでエラーとなる。
R depends on gettext to fix build issue. #18198に書いてあるが、依存ライブラリのcairoがpkgconfigで指定されていないため。
これを参考に、23行目にdepends_on 'cairo'を追加する。
$ brew install R
$ sudo ln -s "/usr/local/opt/r/R.framework" /Library/Frameworks
OSXをLionやMountain LionからMarvericksにアップグレードしている場合、Rをインストールしようとするとエラーになる。
その場合は、一度gfortranと関連するライブラリをbrew uninstallしてから再インストールすると良い。
$ brew uninstall gmp mpfr libmpc cloog gfortran
$ brew install gfortran
$ brew install R
$ R
R version 2.15.3 (2013-03-01) -- "Security Blanket"
(省略)
インストールがうまく行ってもパッケージのインストールで失敗する場合もある。
自分の場合は、install.packages("knitr")で失敗した。
stackoverflowでも質問している人がいて、gettextをインストールすれば良いとのこと。
brew linkしたらWarningでたので、--forceつけて実行したらエラーが解消された。
$ brew install gettext
$ brew link gettext
Warning: gettext is keg-only and must be linked with --force
Note that doing so can interfere with building software.
$ brew link --force gettext
参考ページ
MacOSX に homebrew で R をインストール
Homebrew でバージョンを指定してインストールする
MacOSX に homebrew で R をインストール
Author And Source
この問題について(Rの2系をbrew installする), 我々は、より多くの情報をここで見つけました https://qiita.com/taise/items/136ad3eaf18ba63c3463著者帰属：元の著者の情報は、元のURLに含まれています。著作権は原作者に属する。
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